LGS, tüm öğrencilere aynı soruların sorulduğu merkezi eşit bir sınav gibi görünse de, öğrencilerin sınava hazırlanırken sahip oldukları imkânlar açısından farklılıklar söz konusudur. Büyük şehirlerde veya merkezi yerleşim alanlarında yaşayan, özel ders alıp özel kurs merkezlerine devam eden öğrencilerle, ekonomik zorluklar içinde yaşayan ve eğitim kaynaklarına sınırlı seviyede ulaşabilen öğrenciler, aynı yarışın içinde yer almaktadır.
Bu gerçek, sınavın sonucunu yalnızca öğrencinin bilgi düzeyinin değil, aynı zamanda sahip olduğu eğitim olanaklarının da belirlediği yönündeki eleştirileri güçlendirmektedir. Özellikle son yıllarda, eğitimdeki bölgesel farklılıklar, sınıfların kalabalıklığı, öğretmen eksiklikleri, sınavla ilgili yardımcı yayınlara ulaşamama ve ekonomik koşulların olumsuzluğu daha da görünür hâle gelmiştir.
Yetkililer, sınava giren öğrenci sayısının çok fazla olması ve ortaöğretim okullarının eğitim kalitesi bakımından farklılaşması gibi nedenlere bağlı olarak merkezi sınavın gerekliliğini ifade etmektedirler. Çoktan seçmeli teste dayalı merkezi sınavların eğitimde niteliksel gelişmeyi engellediği açıktır.
